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畜牧兽医所在国际知名遗传学期刊《Genetics Selection Evolution》发表绵羊性状全基因组关联分析研究成果

来源: 发布时间:2021-10-18 09:58:28

近日,畜牧兽医所羊遗传育种与饲养管理创新团队田可川研究员课题组,在国际知名学术期刊《Genetics Selection Evolution》上在线发表了题为“Integration of a single-step genome-wide association study with a multi-tissue transcriptome analysis provides novel insights into the genetic basis of wool and weight traits in sheep”的最新研究成果。
       绵羊毛用和生长性状的遗传改良是重要的育种目标,但其潜在的遗传结构仍不清晰。为了揭示这些性状的遗传基础,该研究对中国美利奴羊的5个毛用性状和1个生长性状(平均纤维直径、纤维直径变异系数、弯曲数、毛长、剪毛量、活体重)进行加权一步法全基因组关联分析,将结果与大规模转录组数据进行整合分析。
       这些性状的遗传力在0.05(CVFD) ~ 0.36(MFD),遗传相关在-0.44(CN vs. LW) ~ 0.77 (GFW vs. LW)。通过整合GWAS信号与500个样品的RNA-seq数据(包含87个组织),鉴定了与性状相关的组织,如肝脏、肌肉和胃肠道与活体重显著相关(FDR<0.05)。21个常染色体上共鉴定出54个QTL,包含81个候选基因。多个候选基因表现出强烈的组织特异性。通过人类全表型关联分析,发现一些候选基因与人类相似的表型显著相关(FDR<0.05)。该研究为毛用和生长性状的生物学和遗传机制提供了理论依据,有助于绵羊复杂性状的遗传改良和基因定位。
       畜牧兽医所田可川研究员为论文通讯作者,团队博士研究生赵冰茹为论文第一作者。该研究得到了国家现代农业产业技术体系(CARS-36)和国家自然科学基金(31760655)项目的资助。
原文链接:
https://gsejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12711-021-00649-8
 

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